Systematické řízení dostupnosti metabolitů pomocí modelů a metod syntetické biologie

Show simple item record
dc.contributor.advisorGeorgiev, Daniel
dc.contributor.authorZach, Pavel
dc.contributor.refereeVignoni, Alejandro
dc.date.accepted2014-06-17
dc.date.accessioned2015-03-25T09:24:51Z
dc.date.available2013-09-23cs
dc.date.available2015-03-25T09:24:51Z
dc.date.issued2014
dc.date.submitted2014-05-16
dc.description.abstractCílem této práce je návrh univerzální programovatelné platformy pro regulaci operonů s využitím měření hladin metabolitů. V první části je uveden přehled mechanismů, které využívají bakterie, společně s alternativami ze syntetické biologie. Jednotlivé role těchto mechanismů jsou vyšetřeny simulacemi fyzikálně relevantních matematických modelů. Ve druhé části jsou uvedeny výhody využití měření metabolitů. Třetí část je pak věnována systémovému návrhu syntetických částí využívajících simultánní transkripce-translace v prokaryotech a měření hladiny metabolitů. V poslední části této práce je pro tyto části vytvořen a validován obecný model.cs
dc.description.abstract-translatedThe goal of this thesis is to design a versatile and programmable operon regulation platform using metabolic intermediate measurements. In the first part, the regulatory mechanisms implemented by bacteria are reviewed, together with the synthetic biology design alternatives. The roles of these mechanisms are investigated using simulations of physically relevant mathematical models. In the second part, the advantages of using the metabolic measurements are shown. The third part is dedicated to systematic design of transcriptional-translational coupling devices that regulate operon expression using metabolic measurements. In the last section, a corresponding general model is developed and validated.en
dc.description.departmentKatedra kybernetikycs
dc.description.resultObhájenocs
dc.format45 s.cs
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier58351
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/12341
dc.language.isoenen
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení.cs
dc.rights.accessopenAccessen
dc.subjectsyntetická biologiecs
dc.subjectregulace operonucs
dc.subjectsimultánní transkripce a translacecs
dc.subjectRNA regulační elementycs
dc.subjectEscherichia colics
dc.subject.translatedsynthetic biologyen
dc.subject.translatedoperon regulationen
dc.subject.translatedtranscriptional-translational couplingen
dc.subject.translatedRNA regulatory elementsen
dc.subject.translatedEscherichia colien
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných vědcs
dc.thesis.degree-levelNavazujícícs
dc.thesis.degree-nameIng.cs
dc.thesis.degree-programAplikované vědy a informatikacs
dc.titleSystematické řízení dostupnosti metabolitů pomocí modelů a metod syntetické biologiecs
dc.title.alternativeSystematic control of metabolite availability using models and methods of synthetic biologyen
dc.typediplomová prácecs
local.relation.IShttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=58351

Files

Original bundle
Showing 1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
Name:
ing-thesis-pavel-zach.pdf
Size:
1.5 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Plný text práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Zach-v.pdf
Size:
2.48 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Zach-o.pdf
Size:
4.28 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Zach-p.pdf
Size:
1.26 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Průběh obhajoby práce
Download

Collections

Theses (KKY)