Systematické řízení dostupnosti metabolitů pomocí modelů a metod syntetické biologie
Date issued
2014
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Západočeská univerzita v Plzni
Abstract
Cílem této práce je návrh univerzální programovatelné platformy pro regulaci operonů s využitím měření hladin metabolitů. V první části je uveden přehled mechanismů, které využívají bakterie, společně s alternativami ze syntetické biologie. Jednotlivé role těchto mechanismů jsou vyšetřeny simulacemi fyzikálně relevantních matematických modelů. Ve druhé části jsou uvedeny výhody využití měření metabolitů. Třetí část je pak věnována systémovému návrhu syntetických částí využívajících simultánní transkripce-translace v prokaryotech a měření hladiny metabolitů. V poslední části této práce je pro tyto části vytvořen a validován obecný model.
Description
Subject(s)
syntetická biologie, regulace operonu, simultánní transkripce a translace, RNA regulační elementy, Escherichia coli