Návrh algoritmu pro identifikaci řídkých haplotypů u dárců kostní dřeně

Show simple item record
dc.contributor.advisorHoudová Lucie, Ing. Ph.D.
dc.contributor.authorVonášek, Adam
dc.contributor.refereeFetter Miloš, Ing.
dc.date.accepted2017-9-14
dc.date.accessioned2018-01-15T15:02:02Z
dc.date.available2016-10-3
dc.date.available2018-01-15T15:02:02Z
dc.date.issued2017
dc.date.submitted2017-8-23
dc.description.abstractPráce se zabývá vývojem automatické metody identifikace řídkých haplotypů. Haplotypy s nízkou pravděpodobností výskytu je velmi obtížné získat základními metodami, tj. Clarkovým, EM a Bayesovým algoritmem. Nová metoda využívá haplotypy již získané k odvozování nových. Pro identifikaci haplotypu je potřeba najít nejlepší shodu varianty haplotypového páru s údaji v dostupné databázi. Často jsou haplotypy natolik vzácné, tj. řídké, že je potřeba přistoupit k analýze jednotlivých genových vazeb. Nedílnou součástí algoritmu je rozhodovací část, která z variant na základě dostupných parametrů vybírá tu nejvhodnější. Pomocí programu je možné stáhnout populační data z webu, případně stávající zaktualizovat. Taktéž je možné program používat pro porovnávání aktuálních výsledků s již dříve získanými.cs
dc.description.abstract-translatedThe thesis deals with development of the automatic rare haplotype identification method. Haplotypes of low occurrence probability are very difficult to obtain by using the elementary methods, i.e. Clark algorithm, EM algorithm, Bayes algorithm. The new method uses haplotypes already obtained to derive new ones. It is necessary to find the best matching of genotype variant and data in the website database available, when doing the haplotype identification. Haplotypes can be so rare, so they need to be identified by single genetic linkages analysis. The decisive algorithm is part and parcel of the algorithm. It chooses the most suitable genotype variant from the possible options. The program can download a population data from a website and it can update the current data. The program is able to compare current results of the algorithm with results previously obtained as well.en
dc.description.resultObhájenocs
dc.format94 s.cs
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier71987
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/27107
dc.language.isocscs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení.cs
dc.rights.accessopenAccessen
dc.subjecttransplantace kostní dřeněcs
dc.subjectidentifikace haplotypůcs
dc.subjectalelacs
dc.subjectřídký haplotypcs
dc.subjectgenotypcs
dc.subject.translatedbone marrow transplantationen
dc.subject.translatedhaplotype identificationen
dc.subject.translatedalleleen
dc.subject.translatedrare haplotypeen
dc.subject.translatedgenotypeen
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných vědcs
dc.thesis.degree-levelNavazujícícs
dc.thesis.degree-nameIng.cs
dc.thesis.degree-programAplikované vědy a informatikacs
dc.titleNávrh algoritmu pro identifikaci řídkých haplotypů u dárců kostní dřeněcs
dc.title.alternativeThe proposal of the rare haplotypes identification algorithm for bone marrow donorsen
dc.typediplomová prácecs
local.relation.IShttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=71987

Files

Original bundle
Showing 1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
Name:
DiplomovaPrace_Vonasek.pdf
Size:
2.68 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Plný text práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Vonasek-v.pdf
Size:
1.27 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Vonasek-o.pdf
Size:
1.65 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Vonasek-p.pdf
Size:
451.89 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Průběh obhajoby práce
Download

Collections

Theses (KKY)