Metoda pro identifikaci MICA a MICB genů

Show simple item record
dc.contributor.advisorHoudová Lucie, Ing. Ph.D.
dc.contributor.authorRottenbornová, Lucie
dc.contributor.refereeOstašov Pavel, Mgr. Ph.D.
dc.date.accepted2021-8-26
dc.date.accessioned2021-08-30T22:12:30Z
dc.date.available2020-10-15
dc.date.available2021-08-30T22:12:30Z
dc.date.issued2021
dc.date.submitted2021-8-16
dc.description.abstractBakalářská práce se zabývá identifikací alel MICA a MICB genů pro následné použití v rámci transplantce kostní dřeně. Cílem práce je seznámení se s významem genů MICA a MICB, porovnání sekvenačních metod, zejména Sangerovo sekvenování a Next-generation sekvenování (NGS), porozumění problematice identifikace alel a následný návrh metody pro automatickou identifikaci alel. Metoda byla vyvíjena na základě syntetických dat s vlastnostmi vycházejícími z reálných experimentů prováděných ve FN Plzeň. Kromě samotné metody realizované v jazyce Python za pomoci rozšíření Biopython je v práci popsán způsob získávání referenčních dat, vytváření syntetických dat a zhodnoceny výsledky ověřování metody.cs
dc.description.abstract-translatedThis bachelor thesis deals with the identification of alleles of MICA and MICB genes for subsequent use in bone marrow transplantation. The aim is to get acquainted with the importance of MICA and MICB genes in bone marrow transplant, comparison of sequencing methods, especially Sanger sequencing and Next-generation sequencing (NGS), understanding the problems of allele identification and subsequent design of method for automatic allele identification. The method was developed based on synthetic data with properties similar to real data from experiments performed at FN Plzeň. In addition to the method implemented in Python using the Biopython extension, the work describes the method of obtaining reference data, creating synthetic data and evaluating the results of verifying the method.en
dc.description.resultObhájenocs
dc.format85 s.cs
dc.identifier86232
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/44977
dc.language.isocscs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení.cs
dc.rights.accessopenAccessen
dc.subjectbioinformatikacs
dc.subjectbioinženýrstvícs
dc.subjectidentifikace genůcs
dc.subjectmicacs
dc.subjectmicbcs
dc.subjectsangerovo sekvenovánícs
dc.subjectsekvenování nové generacecs
dc.subject.translatedbioinformaticsen
dc.subject.translatedbioengineeringen
dc.subject.translatedgene identificationen
dc.subject.translatedmicaen
dc.subject.translatedmicben
dc.subject.translatedsanger sequencingen
dc.subject.translatednext-generation sequencingen
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných vědcs
dc.thesis.degree-levelBakalářskýcs
dc.thesis.degree-nameBc.cs
dc.thesis.degree-programInženýrská informatikacs
dc.titleMetoda pro identifikaci MICA a MICB genůcs
dc.title.alternativeMICA and MICB Gene Identification Methoden
dc.typebakalářská prácecs
local.relation.IShttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=86232

Files

Original bundle
Showing 1 - 5 out of 5 results
No Thumbnail Available
Name:
Dokumentace_Rottenbornova_Lucie.pdf
Size:
1.59 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Plný text práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
rottenbornova-v.pdf
Size:
358.01 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
rottenbornova-o.pdf
Size:
817.95 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
rottenbornova-p.pdf
Size:
177.35 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Průběh obhajoby práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
BP_el_verze_Rottenbornova_Lucie.zip
Size:
4.98 MB
Format:
ZIP
Description:
VŠKP - příloha
Download

Collections

Bachelor´s works (KKY)