Metoda pro identifikaci MICA a MICB genů

Abstract

Bakalářská práce se zabývá identifikací alel MICA a MICB genů pro následné použití v rámci transplantce kostní dřeně. Cílem práce je seznámení se s významem genů MICA a MICB, porovnání sekvenačních metod, zejména Sangerovo sekvenování a Next-generation sekvenování (NGS), porozumění problematice identifikace alel a následný návrh metody pro automatickou identifikaci alel. Metoda byla vyvíjena na základě syntetických dat s vlastnostmi vycházejícími z reálných experimentů prováděných ve FN Plzeň. Kromě samotné metody realizované v jazyce Python za pomoci rozšíření Biopython je v práci popsán způsob získávání referenčních dat, vytváření syntetických dat a zhodnoceny výsledky ověřování metody.

Description

Subject(s)

bioinformatika, bioinženýrství, identifikace genů, mica, micb, sangerovo sekvenování, sekvenování nové generace

Citation

OPEN License Selector