Analýza nástrojů a pipeline pro zpracování long-read sequencing dat
| dc.contributor.advisor | Houdová Lucie, Ing. Ph.D. | |
| dc.contributor.author | Soukupová, Barbora | |
| dc.contributor.referee | Holubová Monika, Mgr. Ph.D. | |
| dc.date.accepted | 2023-6-20 | |
| dc.date.accessioned | 2024-01-15T23:11:15Z | |
| dc.date.available | 2022-10-17 | |
| dc.date.available | 2024-01-15T23:11:15Z | |
| dc.date.issued | 2023 | |
| dc.date.submitted | 2023-5-31 | |
| dc.description.abstract | Long-read sekvenování je technologie, která způsobila revoluci v oblasti genomiky. Na rozdíl od dříve používaných sekvenačních technik, které dokážou přečíst pouze krátké úseky DNA, long-read sekvenování dokáže číst až desítky tisíc bází najednou, což poskytuje nový a komplexnější pohled na genom. Tato práce představuje principy long-read sekvenování a jeho výhody a nevýhody oproti jiným metodám sekvenování. Cílem této práce je poskytnout přehled dostupných nástrojů a pipeline, které jsou k dispozici pro analýzu dat z long-read sekvenování, a také shrnout současné aplikace. | cs |
| dc.description.abstract-translated | Long-read sequencing is a technology that has revolutionised the field of genomics. Unlike previously used sequencing techniques, which are able to read only short fragments of DNA, long-read sequencing can produce reads of tens of thousands of bases in length, providing a new and more comprehensive view of the genome. This thesis introduces the principles of long-read sequencing and its advantages and disadvantages over other sequencing methods. It provides an analysis of the tools and pipelines that are available for long-read sequencing data analysis as well as the current applications. | en |
| dc.description.result | Obhájeno | |
| dc.format | 50 | |
| dc.identifier | 93423 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11025/55120 | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.publisher | Západočeská univerzita v Plzni | |
| dc.rights | Plný text práce je přístupný bez omezení | |
| dc.subject | dna sekvenování | cs |
| dc.subject | long-read sekvenování | cs |
| dc.subject | sekvenování nové generace | cs |
| dc.subject | analýza long-read dat | cs |
| dc.subject | nástroje pro analýzu dat | cs |
| dc.subject | pipeline pro analýzu dat | cs |
| dc.subject.translated | dna sequencing | en |
| dc.subject.translated | long-read sequencing | en |
| dc.subject.translated | next-generation sequencing | en |
| dc.subject.translated | long-read data analysis | en |
| dc.subject.translated | data analysis tools | en |
| dc.subject.translated | data analysis pipeline | en |
| dc.thesis.degree-grantor | Západočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných věd | |
| dc.thesis.degree-level | Bakalářský | |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | |
| dc.thesis.degree-program | Kybernetika a řídicí technika | |
| dc.title | Analýza nástrojů a pipeline pro zpracování long-read sequencing dat | cs |
| dc.type | bakalářská práce |
Files
Original bundle
1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
- Name:
- BP_Soukupova.pdf
- Size:
- 4.74 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Plný text práce
No Thumbnail Available
- Name:
- PosudekOponentaSTAG.pdf
- Size:
- 60.78 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek oponenta práce
No Thumbnail Available
- Name:
- PosudekVedoucihoSTAG.pdf
- Size:
- 61.18 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek vedoucího práce
No Thumbnail Available
- Name:
- Prubeh obhajoby Soukupova.pdf
- Size:
- 80.12 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Průběh obhajoby práce