Možnosti analýzy výsledků multiplových metod pro stanovení specifických IgE

Abstract

Trendem v diagnostice alergických onemocnění jsou především multiplexové metody, které umožňují vyšetřit široký panel alergenů z malého množství pacientského séra. Interpretace výsledků je ovšem velice náročná. Aplikací procesů strojové analýzy na rozsáhlou databázi výsledků testu ImmunoCAP ISAC byla zjištěna korelace mezi alergeny, u nichž jsem následně nalezla i značnou homologii. Homologie byla důsledkem náležitosti alergenů ke stejným proteinovým rodinám. V případech, kdy alergeny nenáležely do stejné proteinové rodiny a nezjistila jsem u nich homologii, ale přesto byla naměřena korelace, jsem zjistila, že cross-reaktivita mezi těmito alergeny se uskutečňuje přes cukernou složku CCD. Lze předpokládat, že implementace strojového učení ulehčí interpretaci výsledků získaných pomocí multiplexových metod.