Screening a identifikace bakteriofágů v lokálních populacích hlodavců

Abstract

Cílem práce byl screening bakteriálních virů neboli bakteriofágů. Studie se zabývala hledáním nových bakteriofágů z trusu hlodavců. Práce byla rozšířena o screening klíštěte (Ixodes sp.). Je totiž známo, že hlodavci i klíšťata jsou přirozenými zdroji bakterií rodu Borrelia, tudíž mohou být v jejich organismech přítomny i bakteriální viry. Využití bakteriofágů v budoucnosti je zřejmé. Existuje velký potenciál využití fágů v léčbě v kombinaci s antibiotiky. Klíčovým výsledkem v této práci je prokázání fungování nové aplikace metodiky amplifikace bakteriofágové DNA. Celkem se podařilo izolovat patnáct druhů bakteriofágové DNA, načež šest bakteriofágů bylo identifikováno a získána jejich sekvence. Novým poznatkem je zjištění příbuznosti a postavení těchto objevených bakteriofágů ve fylogenetických stromech. Prokázala se příbuznost mořských bakteriofágů a fágů, parazitujících na bakteriích, z organismů hlodavců či klíšťat. Příbuznost nově objevených bakteriofágů s rodinou bakteriofágů T7 je diskutabilní, přestože byly tyto nově objevené bakteriofágy izolované primery právě pro rodinu T7 bakteriofágů.