Optimalitace a využití metody long range PCR v analýze variant v genech s výskytem pseudogenů

dc.contributor.advisorZavoral Tomáš, Mgr.cs
dc.contributor.authorVeličková, Janacs
dc.contributor.refereeŠubrt Ivan, MUDr. Ph.D.cs
dc.date.accepted2025-06-25
dc.date.accessioned2026-02-21T21:07:57Z
dc.date.available2024-06-14
dc.date.available2026-02-21T21:07:57Z
dc.date.issued2025-03-31
dc.date.submitted2025-03-31
dc.description.abstractTato bakalářská práce se zabývá optimalizací a využitím metody long range PCR (LR-PCR) při analýze variant v genech s výskytem pseudogenů, konkrétně genu PMS2 a jeho vysoce homologního pseudogenu PMS2CL. Cílem práce bylo navrhnout a optimalizovat reakční podmínky LR-PCR, které umožní spolehlivou amplifikaci genu PMS2 bez kontaminace jeho pseudogenem. V praktické části byla porovnávána účinnost různých metod izolace DNA a složení reakčních směsí na výtěžnost a kvalitu amplifikace. Výsledky ukázaly, že správná volba primerů a optimalizace podmínek LR-PCR mohou výrazně ovlivnit úspěšnost amplifikace cílového genu.cs
dc.description.abstract-translatedThis bachelor thesis deals with the optimization and use of the long range PCR (LR-PCR) method in the analysis of variants in genes with pseudogenes. Specially the PMS2 gene and its highly homologous pseudogene PMS2CL. The aim of the thesis was to design and optimize the LR-PCR reaction conditions that allow reliable amplification of the PMS2 gene without contamination with its pseudogene. In the practical part, the efficiency of different DNA isolation methods and the composition of reaction mixtures on the yield and quality of amplification were compared. The results showed that the correct choice of primers and optimization of LR-PCR conditions can significantly affect the success of target gene amplification.en
dc.description.departmentKatedra záchranářství, diagnostických oborů a veřejného zdravotnictvícs
dc.description.resultObhájenocs
dc.format64 s.
dc.identifier101665
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/66981
dc.language.isocs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezenícs
dc.rights.accessopenAccesscs
dc.subjectPCRcs
dc.subjectlong range PCRcs
dc.subjectpseudogenycs
dc.subjectPMS2cs
dc.subjectPMS2CLcs
dc.subjectLynchův syndromcs
dc.subject.translatedPCRen
dc.subject.translatedlong range PCRen
dc.subject.translatedpseudogenesen
dc.subject.translatedPMS2en
dc.subject.translatedPMS2CLen
dc.subject.translatedLynch syndromeen
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta zdravotnických studiícs
dc.thesis.degree-levelBakalářskýcs
dc.thesis.degree-nameBc.cs
dc.thesis.degree-programLaboratorní diagnostika ve zdravotnictvícs
dc.titleOptimalitace a využití metody long range PCR v analýze variant v genech s výskytem pseudogenůcs
dc.title.alternativeOptimization and use of long range PCR in the analysis of variants in genes with pseudogenesen
dc.typebakalářská prácecs
local.files.count4*
local.files.size3147477*
local.has.filesyes*
local.relation.IShttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=101665

Files

Original bundle
Showing 1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
Name:
velickova_jana_ZL_BP.pdf
Size:
2.3 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
VŠKP
No Thumbnail Available
Name:
PV_Velickova_Z22B0091P.pdf
Size:
319.56 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího VŠKP
No Thumbnail Available
Name:
PO_Velickova_Z22B0091P.pdf
Size:
331.61 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta VŠKP
No Thumbnail Available
Name:
PB_Velickova_Z22B0091P.pdf
Size:
63.9 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Průběh obhajoby VŠKP