Optimalitace a využití metody long range PCR v analýze variant v genech s výskytem pseudogenů
Date issued
2025-03-31
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Západočeská univerzita v Plzni
Abstract
Tato bakalářská práce se zabývá optimalizací a využitím metody long range PCR (LR-PCR) při analýze variant v genech s výskytem pseudogenů, konkrétně genu PMS2 a jeho vysoce homologního pseudogenu PMS2CL. Cílem práce bylo navrhnout a optimalizovat reakční podmínky LR-PCR, které umožní spolehlivou amplifikaci genu PMS2 bez kontaminace jeho pseudogenem. V praktické části byla porovnávána účinnost různých metod izolace DNA a složení reakčních směsí na výtěžnost a kvalitu amplifikace. Výsledky ukázaly, že správná volba primerů a optimalizace podmínek LR-PCR mohou výrazně ovlivnit úspěšnost amplifikace cílového genu.
Description
Subject(s)
PCR, long range PCR, pseudogeny, PMS2, PMS2CL, Lynchův syndrom