Laditelný pulzní generátor v genetických systémech eukaryot
| dc.contributor.advisor | Georgiev Daniel, Doc. PhD. | |
| dc.contributor.author | Sosnová, Anna | |
| dc.contributor.referee | Kasl Hynek, Bc. | |
| dc.date.accepted | 2019-6-20 | |
| dc.date.accessioned | 2020-08-24T11:43:31Z | |
| dc.date.available | 2018-10-1 | |
| dc.date.available | 2020-08-24T11:43:31Z | |
| dc.date.issued | 2019 | |
| dc.date.submitted | 2019-5-24 | |
| dc.description.abstract | Nekoherentní dopředná smyčka typu 1 (I1-FFL), která se chová jako pulzní generátor, je nejběžněji se vyskytujícím typem transkripčních sítí v bakteriích i kvasinkách. Tato práce uvádí nový design pulzního generátoru, který je indukovaný feromonem. Indukce feromonem je použita pro aktivaci přímé dráhy I1-FFL a také pro indukovanou produkci "mrtvé" Cas9 (dCas9). dCas9, převzaté z CRISPR-Cas9 systému, je použito pro represi v nepřímé dráze. Je představen matematický model navrženého systému a neznámé parametry jsou identifikovány experimentálně. Jsou zkoumány 2 mutace sgRNA a je ukázáno, že jejich použitím dojde ke změně dynamického chování systému. | cs |
| dc.description.abstract-translated | Type 1 incoherent feed-forward loop (I1-FFL), which behaves as a pulse generator, is the most common transcription network motif in both bacteria and yeast. This work proposes a new design of pulse generator in yeast cell induced by pheromone. Pheromone induction is used for activation of the direct path of I1-FFL and also induced dead Cas9 (dCas9) production. dCas9 implemented from the CRISPR-Cas9 system is used for the repression in the indirect path. Mathematical model of the system is introduced and unknown parameters are experimentally identified. 2 mutations of sgRNA are examined and it is shown, that their use changes the dynamic behavior of the system. | en |
| dc.description.result | Obhájeno | cs |
| dc.format | 51 s. | cs |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier | 79202 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11025/39268 | |
| dc.language.iso | en | en |
| dc.publisher | Západočeská univerzita v Plzni | cs |
| dc.rights | Plný text práce je přístupný bez omezení. | cs |
| dc.rights.access | openAccess | en |
| dc.subject | pulzní generátor | cs |
| dc.subject | nekoherentní dopředná smyčka | cs |
| dc.subject | matematický model | cs |
| dc.subject | crispr | cs |
| dc.subject | dcas9 | cs |
| dc.subject | kvasinka | cs |
| dc.subject.translated | pulse generator | en |
| dc.subject.translated | incoherent feed-forward loop | en |
| dc.subject.translated | mathematical model | en |
| dc.subject.translated | crispr | en |
| dc.subject.translated | dcas9 | en |
| dc.subject.translated | yeast | en |
| dc.thesis.degree-grantor | Západočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných věd | cs |
| dc.thesis.degree-level | Navazující | cs |
| dc.thesis.degree-name | Ing. | cs |
| dc.thesis.degree-program | Aplikované vědy a informatika | cs |
| dc.title | Laditelný pulzní generátor v genetických systémech eukaryot | cs |
| dc.title.alternative | A tunable pulse generator in eukaryotic gene systems | en |
| dc.type | diplomová práce | cs |
| local.relation.IS | https://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=79202 |
Files
Original bundle
1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
- Name:
- DP_Sosnova.pdf
- Size:
- 2.77 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Plný text práce
No Thumbnail Available
- Name:
- sosnova-v.pdf
- Size:
- 841.22 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek vedoucího práce
No Thumbnail Available
- Name:
- sosnova-o.pdf
- Size:
- 739.89 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek oponenta práce
No Thumbnail Available
- Name:
- sosnova-p.pdf
- Size:
- 365.22 KB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Průběh obhajoby práce