Nástroj pro detekci buněčných jader v mikroskopických histologických obrazech

Show simple item record
dc.contributor.advisorJiřík Miroslav, Ing. Ph.D.
dc.contributor.authorBurian, Jan
dc.contributor.refereeZítka Tomáš, Mgr.
dc.date.accepted2022-6-21
dc.date.accessioned2022-07-18T22:33:57Z
dc.date.available2021-10-15
dc.date.available2022-07-18T22:33:57Z
dc.date.issued2022
dc.date.submitted2022-5-23
dc.description.abstractTato bakalářská práce se věnuje vytvoření nástroje pro detekci buněčných jader v mikroskopických histologických obrazech, které byly obarveny barvením H&E. Při návrhu nástroje byl kladen důraz především na detekci jader jaterních buněk. Pomocí tohoto nástroje je rovněž možné natrénovat nové modely. Nástroj k predikci dat a trénování nových modelů využívá framework Detectron2, vytvořený organizací Facebook AI Research. Jako algoritmus pro detekci objektů byl zvolen algoritmus Mask R-CNN, který je součástí Detectronu2. Obecně bylo využito konvolučních neuronových sítí, jako jednoho z nástrojů počítačového vidění. Pro praktické využití nástroje byla vytvořena webová aplikace. Jako experiment bylo natrénováno šest modelů, které byly určeny přímo k detekci jaterních buněčných jader.cs
dc.description.abstract-translatedThe main aim of this work is to develope a tool for the detection of cell nuclei in H&E microscopic histological images. When the tool was designed, it was mainly focused on the detection of liver cell nuclei. This tool can be also used for training new models. For the prediction and the training, the tool implements Detectron2 framework, which is developped by Facebook AI Research. As an object detection algorithm Mask R-CNN was chosen which is included in Detectron2. Basicly, the tool is based on the convolutional neural network, in this case neural network is used as one of the computer vision methods. Mainly for the practical usage of the tool, the web application was created. As an experiment the six models was trained for the detection of cell nuclei.en
dc.description.resultObhájeno
dc.format57
dc.identifier90057
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/49100
dc.language.isocs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plzni
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení
dc.subjectbuněčná jádracs
dc.subjectlékařstvícs
dc.subjectkonvoluční neuronové sítěcs
dc.subjectpočítačové viděnícs
dc.subjectumělá inteligencecs
dc.subjectmask r-cnncs
dc.subjectdetectron2cs
dc.subject.translatedcell nucleien
dc.subject.translatedmedicineen
dc.subject.translatedconvolutional neural networksen
dc.subject.translatedcomputer visionen
dc.subject.translatedartificial intelligenceen
dc.subject.translatedmask r-cnnen
dc.subject.translateddetectron2en
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných věd
dc.thesis.degree-levelBakalářský
dc.thesis.degree-nameBc.
dc.thesis.degree-programKybernetika a řídicí technika
dc.titleNástroj pro detekci buněčných jader v mikroskopických histologických obrazechcs
dc.title.alternativeA tool for the detection of cell nuclei in microscopic histological imagesen
dc.typebakalářská práce
local.relation.IShttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=90057

Files

Original bundle
Showing 1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
Name:
BP_final_Burian.pdf
Size:
13.53 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Plný text práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Burian_V.pdf
Size:
423.58 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Burian_O.pdf
Size:
489.61 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta práce
Download
No Thumbnail Available
Name:
Burian_P.pdf
Size:
223.11 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Průběh obhajoby práce
Download

Collections

Bachelor´s works (KKY)