Vizualizace dělení prostoru v dynamických modelech makromolekul

dc.contributor.advisorMaňák Martin, Mgr. Ph.D.
dc.contributor.authorŠťáva, Oto
dc.contributor.refereeHruda Lukáš, Ing.
dc.date.accepted2020-6-16
dc.date.accessioned2020-11-10T00:38:58Z
dc.date.available2019-10-7
dc.date.available2020-11-10T00:38:58Z
dc.date.issued2020
dc.date.submitted2020-5-7
dc.description.abstractModelování a vizualizace makromolekulárních struktur proteinů jsou důležitou součástí medicínské informatiky. Tyto vizualizace mohou experti v tomto oboru využívat ke hledání a zkoumání biologicky aktivních míst v těchto molekulách. Ke hledání dutin a tunelů, které mohou představovat možné přístupové cesty k těmto aktivním místům, jsou využívány algoritmy využívající dělení prostoru do Voroného diagramů. Tato práce se zabývá grafickou vizualizací aditivně vážených Voroného diagramů za účelem výzkumu chování těchto diagramů, a to zejména nad dynamickými modely molekul. Součástí práce je softwarová implementace této vizualizace v podobě rozšiřujícího modulu pro aplikaci CAVER Analyst.cs
dc.description.abstract-translatedModelling and visualization of macromolecular protein structures play an important part in medical informatics. These visualizations may be used by medical experts to search for and examine biologically active places in these molecules. Existing software solutions use algorithms based on analysis of space partitioning into Voronoi diagrams to find cavities and tunnels, which may be used as potential access paths to those active places. This thesis concerns graphical visualization of additively weighted Voronoi diagrams, which would allow further examination of their behaviour, particularly in dynamically changing molecule models. As a part of the thesis, an extension module for the software application CAVER Analyst visualizing these diagrams was implemented.en
dc.description.resultObhájenocs
dc.format53 s.cs
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier82902
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11025/41788
dc.language.isocscs
dc.publisherZápadočeská univerzita v Plznics
dc.rightsPlný text práce je přístupný bez omezení.cs
dc.rights.accessopenAccessen
dc.subjectvoroného diagramcs
dc.subjectpočítačová grafikacs
dc.subjectvizualizacecs
dc.subjectdělení prostorucs
dc.subjectbézierova křivkacs
dc.subjectopenglcs
dc.subjectgeometry shadercs
dc.subjectalgoritmus de casteljaucs
dc.subject.translatedvoronoi diagramen
dc.subject.translatedcomputer graphicsen
dc.subject.translatedvisualizationen
dc.subject.translatedspace partitioningen
dc.subject.translatedbézier curveen
dc.subject.translatedopenglen
dc.subject.translatedgeometry shaderen
dc.subject.translatedde casteljau algorithmen
dc.thesis.degree-grantorZápadočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných vědcs
dc.thesis.degree-levelBakalářskýcs
dc.thesis.degree-nameBc.cs
dc.thesis.degree-programInženýrská informatikacs
dc.titleVizualizace dělení prostoru v dynamických modelech makromolekulcs
dc.title.alternativeSpace Partitioning Visualization in Dynamic Macromolecular Modelsen
dc.typebakalářská prácecs
local.relation.IShttps://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=82902

Files

Original bundle
Showing 1 - 4 out of 4 results
No Thumbnail Available
Name:
BP_Oto_Stava_final.pdf
Size:
25.7 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Plný text práce
No Thumbnail Available
Name:
A16B0148P_Hodnoceni.pdf
Size:
27.51 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek vedoucího práce
No Thumbnail Available
Name:
A16B0148P_Posudek.pdf
Size:
135.67 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Posudek oponenta práce
No Thumbnail Available
Name:
A16B0148P_Obhajoba.pdf
Size:
82.38 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Průběh obhajoby práce