Citlivostní analýza metod identifikace haplotypů
| dc.contributor.advisor | Houdová, Lucie | |
| dc.contributor.author | Vonášek, Adam | |
| dc.date.accepted | 2014-06-19 | |
| dc.date.accessioned | 2015-03-25T09:51:37Z | |
| dc.date.available | 2013-11-01 | cs |
| dc.date.available | 2015-03-25T09:51:37Z | |
| dc.date.issued | 2014 | |
| dc.date.submitted | 2014-05-16 | |
| dc.description.abstract | Práce se zabývá citlivostní analýzou metod pro identifikaci haplotypů. V teoretické části jsou obsaženy základní poznatky o transplantaci krvetvorných buněk, reakcích imunitního systému na ni, informace o HLA ("Human leucocyte antigens") znacích, způsobech typizace HLA znaků, a teoretický rozbor metod identifikace haplotypů, tj. Clarkova, EM ("Expectation-Maximization") a Bayesova algoritmu. Praktická část je věnována implementaci dvou zvolených algoritmů v prostředí programovacího jazyka Java, jejich výsledkům a zhodnocení, co se týče předností a nedostatků, které jsme stanovili na základě implementace. Na konci práce se nachází výkladový slovník pojmů. | cs |
| dc.description.abstract-translated | The work deals with a haplotype identification methods sensitivity analysis. A theoretical section should provide basic facts about haematopoietic stem cells transplantation, following reactions of immune system, HLA ("Human leucocyte antigens") types, methods for typing and a theoretical analysis of the haplotype identification methods, i.e. Clark, Expectation-Maximization and Bayes algorithm. A practical section focuses on two elected methods implementation using the computer programming language Java, results and an evaluation on advantages and disadvantages derived by the implementation. There is a monolingual dictionary at the end of the work. | en |
| dc.description.department | Katedra kybernetiky | cs |
| dc.description.result | Obhájeno | cs |
| dc.format | 53 s. | cs |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier | 59737 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/11025/15258 | |
| dc.language.iso | cs | cs |
| dc.publisher | Západočeská univerzita v Plzni | cs |
| dc.rights | Plný text práce je přístupný bez omezení. | cs |
| dc.rights.access | openAccess | en |
| dc.subject | transplantace kostní dřeně | cs |
| dc.subject | krvetvorné buňky | cs |
| dc.subject | HLA | cs |
| dc.subject | HLA typizace | cs |
| dc.subject | alela | cs |
| dc.subject | haplotyp | cs |
| dc.subject | genotyp | cs |
| dc.subject | Clarkův algoritmus | cs |
| dc.subject | EM algoritmus | cs |
| dc.subject.translated | bone marrow transplantation | en |
| dc.subject.translated | haematopoietic stem cells | en |
| dc.subject.translated | HLA | en |
| dc.subject.translated | HLA typing | en |
| dc.subject.translated | allele | en |
| dc.subject.translated | haplotype | en |
| dc.subject.translated | genotype | en |
| dc.subject.translated | Clark algorithm | en |
| dc.subject.translated | EM algorithm | en |
| dc.thesis.degree-grantor | Západočeská univerzita v Plzni. Fakulta aplikovaných věd | cs |
| dc.thesis.degree-level | Bakalářský | cs |
| dc.thesis.degree-name | Bc. | cs |
| dc.thesis.degree-program | Aplikované vědy a informatika | cs |
| dc.title | Citlivostní analýza metod identifikace haplotypů | cs |
| dc.title.alternative | The sensitivity analysis of haplotype identification methods | en |
| dc.type | bakalářská práce | cs |
| local.relation.IS | https://portal.zcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=59737 |
Files
Original bundle
1 - 3 out of 3 results
No Thumbnail Available
- Name:
- BP_Vonasek_15_5_2014.pdf
- Size:
- 1.75 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Plný text práce
No Thumbnail Available
- Name:
- Vonasek-v.pdf
- Size:
- 3.84 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Posudek vedoucího práce
No Thumbnail Available
- Name:
- Vonasek-p.pdf
- Size:
- 1.41 MB
- Format:
- Adobe Portable Document Format
- Description:
- Průběh obhajoby práce