Paralelizace geometrických výpočtů pro analýzu biomolekul

Date issued

2016

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Západočeská univerzita v Plzni

Abstract

Bakalářská práce se zabývá paralelním výpočtem molekulárního povrchu v programovacím jazyku OpenCL. Nová implementace dosahuje až 60% zrychlení pro nejobjemnější výpočty. V úvodní části je probrána nezbytná teorie Voronoi diagramů a jejich duální struktury. Následuje shrnutí současné implementace a popis nové, paralelní. V závěru nechybí detailní porovnání výsledků obou implementací napříč různými testovacími daty.

Description

Subject(s)

opencl, connolly surface, molekulární povrch, gpu

Citation

OPEN License Selector