Paralelizace geometrických výpočtů pro analýzu biomolekul
Date issued
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Západočeská univerzita v Plzni
Abstract
Bakalářská práce se zabývá paralelním výpočtem molekulárního povrchu v programovacím jazyku OpenCL. Nová implementace dosahuje až 60% zrychlení pro nejobjemnější výpočty. V úvodní části je probrána nezbytná teorie Voronoi diagramů a jejich duální struktury. Následuje shrnutí současné implementace a popis nové, paralelní. V závěru nechybí detailní porovnání výsledků obou implementací napříč různými testovacími daty.
Description
Subject(s)
opencl, connolly surface, molekulární povrch, gpu